Terytorialny zasięg działania Naczelnika Urzędu Skarbowego w Braniewie obejmuje powiat braniewski, w skład którego wchodzą:

• miasto Braniewo
• gminy: Braniewo, Frombork, Lelkowo, Pieniężno, Płoskinia, Wilczęta

Siedzibą Naczelnika Urzędu Skarbowego w Braniewie jest miasto Braniewo.