Terytorialny zasięg działania Naczelnika Urzędu Skarbowego w Szczytnie obejmuje powiat szczycieński, w skład którego wchodzą:

• Miasto Szczytno;
• Gminy: Dźwierzuty, Jedwabno, Pasym, Rozogi, Szczytno, Świętajno, Wielbark;